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La Asamblea Nacional es la máxima autoridad de la Asociación y se reúne ordinariamente una vez al año, en esta instancia se definen los objetivos institucionales para el nuevo año, se eligen a los Consejeros Nacionales y se da lectura y aprobación de informes de gestión del año.
A esta asisten representantes de todos los distritos del Ecuador, así como los miembros del Consejo Nacional.
Este año se ha elegido a Quito como la sede para la Asamblea Nacional que se realizará el 12 y 13 de abril.